市传染病医院始建于1965年,医院占地面积2万m2,建筑面积5700 m2,交通便利。主要担负着市区以及四区四县的传染病防治、应对突发疫情以及传染病防治健康教育工作。医院设有呼吸道传染科,消化道传染科及急性病传染科三大临床科室。2004年新增了艾滋病病房及艾滋病检验室。另外设有放射科、超声诊断科、检验科、药械科、防疫科等功能完备的医技科室以及先进的医疗设备全自动生化仪、高频X光机、荧光PCR检测仪、血液过滤机、肺功能仪、中央监护系统等。
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