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利用基因组分析,TGen 正在为转移性肾癌患者制定个体化治疗方案

来源:希望之城 2020-08-07 14:18:28

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医师、科学家们正在使用世界上最全面的基因组分析工具之一来确定靶向疗法或免疫疗法是否对每一位单个患者具有最佳疗效。

希望之城和转化基因组学研究所(TGen)的专家们正在使用世界上最全面的基因组分析工具之一,为转移性肾癌患者制定个体化治疗计划。

尽管医师、科学家正处于漫长征程的开始,但他们相信自己走在正确的道路上。他们最近在《癌症免疫疗法期刊》(Journal of Immunotherapy of Cancer)上发表了一项研究,该研究表明 TERT 基因的突变预示着患者可能无法接受免疫检查点抑制剂(如 nivolumab 或 pembrolizumab)。

Sumanta Kumar Pal
M.D.

「我们希望有一天能确定免疫疗法对哪些患者有益,对哪些人将无效。最终,我们也许能够区分出哪位患者更适合于其他疗法,如靶向疗法等。」 该研究的资深作者、希望之城肾癌项目联合主任 Sumanta Pal 博士表示。希望之城是世界著名的癌症、糖尿病和其他威胁生命的疾病的独立研究和治疗中心。靶向治疗的例子包括血管内皮生长因子(VEGF)酪氨酸激酶抑制剂,如 cabozantinib 等。

据美国癌症协会称,今年将诊断出近 74,000 例新的肾癌病例,约有 14,800 人死于该病。具有讽刺意味的是,专家们知道具有某些基因突变的患者更易受特定药物的影响,但大多数医生并未对每位肾癌患者的肿瘤进行基因测序。

上图为世界卫生组织 2018 年中国肿瘤流行病统计数据,相较于美国,中国在 2018 年有着相似的肾癌新发病例数量,但死亡率更高。

他补充表示:「这是一个悖论:我们没有以定向的方式使用靶向疗法。在希望之城,我们已开始为所有患有 4 期癌症的患者提供全面的基因组和外显子组测序,不论他们的癌症部位位于何处。」

希望之城有望成为美国唯一能够对每位患不同类型癌症的病人进行遗传学分析的重要癌症中心。目的是为了让患者能够接受有效的靶向治疗或尽早让人们参与创新的临床试验,以便他们可以对抗疾病。

在这项研究中,Pal 博士和他的同事将 91 位患者的肿瘤样本送到了 TGen 的临床实验室 Ashion Analytics,以便可以利用 GEM ExTra 对这些样本进行测序。这项前沿工具具有肿瘤标准全外显子组测序和肿瘤全转录组测序功能。这些是对每个患者整个蛋白质编码 DNA 和 RNA 进行分子水平分析。

该项研究的共同作者,同时也是 TGen 整合癌症基因组学部助理教授的 Sara Byron 博士说道:「我们的目标是确定与治疗响应相关的基因组改变。我们希望利用这一'真实证据'来探索与响应相关的潜在分子和基因组特征。」(Ashion Analytics 实验室最近宣布,美国联邦医疗保险 Medicare 已经批准了 GEM ExTra 的承保范围,这能让 4400 万患者有机会参与测试,接受针对各自疾病的最佳可用治疗方法。) 

自 2015 年以来,涉及靶向疗法或免疫疗法的肾癌治疗方案已迅速发展。由于新疗法发展如此之快,科学家尚未找到对方案进行测序以取得最佳疗效的理想策略。此外,该研究报道,目前评估治疗风险的方法往往带有主观偏见。希望之城和 TGen 正在努力开发针对肾癌的客观的、基于实验室的生物标记。 

该研究仅包括在全身治疗之前进行基因组分析的患者。这些患者要么接受了被称为 VEGF 酪氨酸激酶抑制剂(sunitinib、cabozantib、lenvatinib/everolimus)的靶向疗法,要么接受了免疫疗法(nivolumab、ipilimumab、pembrolizumab)。他们被分为临床未受益者(也就是病情进一步发展)和临床受益者(病情出现好转或已经连续六个月以上病情稳定)。通过对大约 19,396 个基因和核酸序列进行分析,在患者特定的肿瘤突变基础上,制定出最适合每个患者的治疗方案。虽然还需要对更大样本量进行更多研究,但科学家们现在有了一个良好的开端。

Pal 博士表示:「四期癌症通常被认为是无法治愈的,但并非总是如此。通过对所有编码蛋白质的 DNA 进行测序,即对整个外显子组进行测序,我们也许能够确定新的治疗靶点,这是一个非常令人兴奋的前景。」

 

转化基因组学研究所(TGen)是一家位于亚利桑那州凤凰城的非营利组织,其使命在于致力于开展突破性研究,取得改变生命的成果。

TGen 隶属于希望之城,后者是世界知名的独立癌症研究与治疗中心,主要研究和治疗癌症、糖尿病及其他危及生命的疾病。这种精准的医学合作关系使得两个机构在医学研究和患者护理方面相得益彰,而希望之城则为推进 TGen 的科学发现提供了重要的临床环境。TGen 专注于通过前沿的转化研究(快速将研究成果提供给患者)帮助患有神经系统疾病、癌症、糖尿病和传染病的患者。TGen 的医生和科学家致力于揭示成人和儿童常见病和复杂罕见病的遗传成分。

TGen 与全球科学和医学界的专家进行合作,通过提高转化过程的效率和有效性,为帮助我们的患者做出了巨大贡献。