发布于:2021-10-22
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ASHG2021:复发性 B-ALL 出现染色体异常 -17/17p- 需要引起临床重视

2021 年 10 月 18 日-22 日,美国人类遗传学学会(ASHG-2021)年会以虚拟会议形式举行。高博诊断中心细胞遗传实验室晏炬主任团队在分子诊断实验室郑勤龙主任团队的协作下的最新研究成果被 ASHG-2021 年会收录为 Poster presentation 向全世界 8000 余名遗传学界的专家和学者们进行宣展。

急性 B 淋巴细胞白血病(B-ALL)是儿童中最常见的血液恶性肿瘤。目前,一些常见的染色体异常被 WHO 文件收录成为判断 B-ALL 预后风险的重要指标。在众多染色体异常种类中,4 号和 11 号染色体易位,即 t(4;11)(q21;q23) 所导致的 KMT2A-AF4 融合基因可以直接判定为 B-ALL 预后差的高风险因子。

文献还提示,t(4;11)(q21;q23) 异常核型往往伴有各种额外的染色体异常。本研究首次揭示,t(4;11)(q21;q23) 常常伴有-17/17p-染色体异常,如同时用 FISH 或基因测序检测到 TP53 基因功能丢失性变异,即可提示为杂合性缺失(LOH,Loss of heterozygosity)。

此类患者预后更差,难以仅用常规化疗方案治愈。一旦查出,应该尝试更积极的治疗,比如联合 CART、抗体、异基因造血干细胞移植、靶向治疗等。

人类正常体细胞有 23 对同源染色体,当其中一对同源染色体上的某个同等位点的基因(等位基因)发生变化时,这一对基因就成为杂合状态。多数情况下,处在杂合状态下的基因仍然能发挥作用,因等位基因中未发生变化的那一个基因(野生型)仍能指导相应蛋白质的合成。但是,当这个等位基因也发生突变或缺失,这对基因就丧失了杂合性。先前变异的基因通常会用不同方式复制一份。这个现象就叫杂合性缺失(LOH)。

LOH 在癌症中普遍存在,已有研究表明,LOH 会导致抑癌基因 TP53 的失活,从而促进癌症的发生与发展。TP53 基因是一种抑癌基因,其编码的 p53 蛋白在细胞周期调控和 DNA 损伤后的细胞凋亡中起着至关重要的作用。在一对等位基因以杂合状态存在时,还会抑制恶性肿瘤的发生。当一个等位基因因突变已经处于没有活性的状态,而另一个等位基因明显异常或缺失时(LOH)就不再有抑癌功能,细胞就会转化为癌细胞。LOH 是影响血液恶性疾病疗效和预后的重要因素。

高博诊断中心细胞遗传实验室晏炬主任团队在分子诊断实验室郑勤龙主任团队的协作下研究了 KMT2A-AFF1 融合伴-17/17p-染色体异常以及 TP53 基因突变的 B-ALL 患者,初步评估了 LOH 的发生及其对患者预后的影响。

研究纳入了 25 例具有 t(4;11)(q21;q23) 染色体异常的 B-ALL 患者,对其中核型检测到的-17/17p-、FISH 检测到的 TP53 位点缺失和二代测序(NGS)检测到的 TP53 基因突变的病例的结果结合临床信息进行评估。其中男性 14 例,女性 11 例,年龄 5 个月至 45 岁(中位年龄 10 岁)。25 例患者中,有 23 例采用 FISH 技术 P53 探针检测,发现 13 例(56.5%)为 TP53 位点缺失(阳性)。而在做过二代测序检测的 17 例患者中发现 13 例(76.5%)为 TP53 基因突变。25 例患者均接受多疗程治疗。其中只有 2 例首次诊断为 B-ALL,其余均在不同的临床病程中复发。25 例患者中有 7 例在不同治疗方案下曾有过暂时缓解,其中 4 例患者用测序技术和细胞遗传学分析均未发现 TP53 基因的异常,染色体也未发现-17/17p-。

研究结果显示,具有 t(4;11)(q21;q23)/KMT2A-AFF1 融合基因的 B-ALL 患者经常出现额外的染色体异常,其中最常见的是-17/17p-。在同一组患者中,FISH 检测到 TP53 位点缺失与核型结果一致。NGS 显示的致病性 TP53 突变在这些患者中非常常见,也与 FISH 结果高度一致,提示患者因 LOH 而丧失 TP53 基因正常的抑癌功能。

考虑本组 B-ALL 病例的高复发频率,团队提出:额外的遗传学异常,特别是-17/17p-,往往在带有 t(4;11)(q21;q23) 染色体异常的 B-ALL 病例中容易进一步演变,导致 TP53 基因的杂合性丢失,并与这种类型白血病的预后不良直接相关。因此,细胞遗传学发现的 17 号染色体上 TP53 位点的缺失可提示 LOH 在 B-ALL 中的存在。

研究者说

预后不良标志物:染色体异常-17/17p-应引起临床重视

KMT2A-AFF1 融合基因是 B-ALL 的特异性染色体异常,KMT2A/AFF1 融合蛋白高表达往往预后不良,伴 KMT2A-AFF1 融合的 ALL 患者治疗失败风险较高。我们团队分析了 KMT2A-AFF1 融合伴-17/ 17p -以及 TP53 基因突变的 B-ALL 患者,评估了抑癌基因杂合性丢失的发生及其对该类患者预后的影响。

我们的研究发现,具有 t(4;11)(q21;q23) 染色体异常的 B-ALL 的临床进程中极易衍生出-17/17p-为主的额外染色体异常,造成 TP53 基因的杂合性丢失,这一遗传学异常的演变与该类患者的极差预后直接相关,这可能也是患者反复复发的原因,其或可作为该类型白血病预后不良的一个标志物。应该引起临床重视。

针对该类型患者,建议首先做染色体检查,特别在检测到 t(4;11)(q21;q23) 染色体异常时应重点关注 17 号染色体或者 17 号染色体短臂有无缺失,同时进行 FISH 检测,从基因的角度去观察有无 P53 位点的缺失。如果有问题,应该立即进行二代测序等分子检测,以确定剩下的 17 号染色体上是否存在 TP53 基因的突变,即 LOH。这些实验室检测结果与临床信息相结合,对判断患者的预后、指导临床强化化疗手段等将具有重要意义。

参考文献:

Ju Yan, Qinglong Zheng, et al. Chromosomal abnormality -17/17P- in acute B-lymphoblastic leukemia (B-ALL) implies loss of heterozygosity of TP53 gene. ASHG2021 abstracts.

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